遗憾的是，这座寺院在“十年动乱”中未能幸免恶运，被彻底摧毁化为一片废墟。前述寺内存藏的大量依止圣物和珍贵文物全部毁于一旦，连赤钦·坚赞桑盖的肉身也被焚之一炬，其损失之惨重将永远无法弥补。

    党的十一届三中全会以后，随着拨乱反正，党的民族政策和宗教信仰政策又得以贯彻，1980年，该寺准许重新开放兴建。是年九月二十二日，三十余名僧人在原寺址废墟上支起一顶帐篷，作为临时诵经堂举行了开光诵经仪式，从此拉开了重建寺院的序幕。

    重建工作在国务院宗教事务局和地方党政部门的关怀下，特别在赤钦·坚赞桑盖化身现辈第五世赛赤活佛·洛藏南杰·龙仁桑盖亲自主持下，得到了寺属各地僧俗教民的鼎力协助，经过十七、八年的共同艰苦努力，先后重新建成弥勒殿、灵塔殿（重制了赤钦灵塔）、马头明王殿、护法殿、祈寿殿、藏经宫（原赛赤活佛囊欠）、赛赤活佛寝宫、祥和大白塔，还有经过几年精心设计建造的大经堂业已竣工开光。此外正在兴建中的活佛囊欠七八处，僧舍近百余院，现有住寺僧侣四百多名，已具备相当规模。

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